一、丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯

1、如果丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證；

2、如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件到主管稅務機關認證，認證相符的憑該專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關同意后，可作為增值進項稅額的抵扣憑證。

二、丟失已開具專用發票的抵扣聯

3、如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票聯復印件留存備查。

4、如果丟失前未認證的，可使用專用發票的發票聯到主管機關認證，專用發票的發票聯復印件留存備查。

三、丟失已開具專用發票的發票聯

5、可以將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，專用發票抵扣聯復印件留存備查。

增值稅發票丟失怎么辦？處理流程：

首先要到辦稅廳領取并填寫《發票掛失/損毀報告表》，并且要在報紙上刊登遺失聲明，申請主管稅務局出《丟失增值稅專用發已報稅證明單》。

《丟失專用已報稅證明單》申請開具流程：

（一）申請。納稅人攜帶上述資料到辦稅服務廳申報征收崗申請開具丟失專用已抄報稅證明單。

（二）受理審核。辦稅服務廳申報征收崗受理審核納稅人提交的資料。符合條件的，當場受理辦理。納稅人提交紙質資料不全或者填寫內容不符合的，一次性告知納稅人補正或重新填報。

（三）開具。納稅人提供資料符合條件的，辦稅服務廳申報征收崗即時開具丟失專用已抄報稅證明單。

以上就是增值稅發票丟失怎么辦的問題。盡管增值稅發票丟失有一定的補救措施，但盡可量不要丟失發票，要保管妥善。