專利申請有電子申請和紙質申請兩種方式，對申請人來說，差別在于電子申請才可以申請發明專利的加快審查。對正穗財稅知識產權代理機構來說，有些政府給的補助需要代理機構的電子申請率達到百分之多少，某些特殊的時候也會需要紙件提交。

專利電子申請和紙質專利本質并無任何差別，但是電子申請是趨勢，因為電子化會方便提交和管理，效率更好。

但目前涉及保密審查、國防專利等只能紙質申請。另外，一般的紙質申請，可以通過請求轉化為電子申請。電子申請需要更名的話，可以通過電子系統提交補正文件。

紙質受理通知書如果是紙質申請一般當天受理。電子版受理通知書是3-7個工作日內先生成電子版，后15個工作日左右送達紙質受理通知書。 

假如申請量少的話沒必要電子申請，電子申請要去當地知識產權局申請數字證書，比較麻煩。申請量多的話，可以服務電子申請，電子申請速度比較快；無需紙件，直接通過網絡上交給國家。

紙質申請專利是任何人都可以的，也可以選擇委托正穗財稅知識產權代理，統一寄到國家知識產權局專利局受理處收。